实验小白,最近想做某蛋白的乙酰化水平,我先用免疫沉淀富集,再用泛乙酰化抗体去拉,目前我认为需要变性前上清跑内参,变性后跑乙酰化水平,但是我想问一下,这样做免疫沉淀还需要做input组和IgG组
本人才学这方面的知识,看到有资料说,David数据库更新比较迟,请问前辈们,如果用r语言的enrichgo和enrichkegg来做,r语言富集分析的数据库是来源于什么数据库,结果是最新的吗?
一个大的基因集合作为背景,一个小的基因集合,先做富集分析!得到一个结果(可能是一个具体的结果,一个数值把),然后随机从背景基因集合中取跟小的基因集合大小相同的伪基因集合,随机1000次,算1000
求助各路大佬,下面A图和B图哪个表示【TG组抑制T signaling pathway】呀,(白线是我打的码),实在不会看ES为负值的GSEA,并求大佬稍稍讲解一下,琢磨整整一天了 T-T。以及对应的
不知道分析过转录组的小伙伴有没有碰到过这样的问题:转录组后续做GO富集的时候,发现最前面的那些term其实对应的基因都差不多,如果选前几个画图,可能说明的只是一件事。我一般是手动选,在足够显著的前提
run后报错---- Full Error Message ----After pruning,这是什么原因啊,前面设置有问题还是就是没有富集到基因?我的数据分了两组,每组3个样本,3万多个基因
kk--> No gene can be mapped....--> Expected input gene ID: 3101,51703,10941,2180,37,2539--> return N