收集了病人的血样,将血清提取保存了,后期要做翻译后的修饰检测,老师说要先做IP实验富集目的蛋白,在进行修饰检测,但是没有找到相关的文献参考,想问大家有用血清样本做IP实验然后进行质谱检测的吗?
想问下大神们,我查了一下,富集分析有好多种工具(DAVID,metascape ,Gluego,KOBAS等)请问这个图上说的是用什么分析的?一般这些分析工具根据什么选择使用?结果有区别
找了好几家试剂商,都没有我需要的能做IP试验的抗体,又在网上找了几家,说明写着可以用于IP实验,但是都没有经过验证,无法保证售后!这该怎么办?还有单克隆和多克隆抗体该怎么选呢?
筛选出差异基因,结果富集分析GO和KEGG分析,大部分条目都>0.05,比如go-cc才2个<0.05,FDR大部分是1,这说明这个研究没多大意思了吗,没有继续分析的必要了吗?审稿人会不会因此拒稿
1.得到差异基因,然后KEGG/GO富集分析功能聚类,再在感兴趣的某个功能集合里做PPI,找hub基因,hub基因结合临床信息分析2.得到差异基因,所有基因全部先做PPI蛋白互作,找hub基因