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关于GO和KEGG富集分析显著性判断

GO和KEGG分析究竟是p value小于0.05就算是显著性富集还是q value小于0.05才算有显著性富集？我现在在做转录组分析，但是筛选出来的差异基因进行富集分析，p值小于0.05的有很多

丁香园- 基础科研-细胞生物与生物信息- 2020-05-29 03:01:35

磷酸肽富集方向的求帮助

大家做富集都用的什么蛋白样品啊，从哪里购买的？

丁香园- 基础科研-蛋白质和糖学- 2014-12-04 02:18:50

求基于reactome的富集性分析软件

求基于reactome的富集性分析软件

丁香园- 基础科研-细胞生物与生物信息- 2012-10-11 06:34:53

富集分析要上条和下调分开去做吗？

最近收了一批蛋白组学的数据，有的前辈说不分上下调的蛋白所有混在一起去富集，有的说需要把上调和下调的蛋白分开，各自去做富集，虽然心里觉得分开做好像更靠谱，但是有两个疑问:1.如果分开去做，那么某个生物

丁香园- 基础科研-蛋白质和糖学- 2023-03-13 08:05:37

已知信号通路，怎样富集相关miRNA？

各位老师好，我看大家做的都是已知miRNA，富集相关的信号通路。有谁知道，已知信号通路，怎样富集相关的miRNA吗？DAVID和KEGG可以吗？怎样使用？请不吝赐教，谢谢各位老师！提前祝大家春节快乐！

丁香园- 基础科研-细胞生物与生物信息- 2018-01-30 02:31:55

【求助】关于富集磷酸化蛋白的方法

目前富集磷酸化蛋白的方法比较多，请XDJM不吝赐教，谈谈各种方法的优缺点！

丁香园- 基础科研-蛋白质和糖学- 2010-10-26 11:48:52

RNA-seq后分析Treg里面富集的基因

求问，看以前文献，作者做了RNA测序以后，从中鉴定了在Treg中富集的基因，然后得到的图，想知道这个图使用什么方法做的？？谢谢大神！

丁香园- 基础科研-核酸基因技术- 2018-04-11 15:45:06

蜈蚣草砷超富集机理

article/pii/S0304389419300706蜈蚣草是一种砷超富集的蕨类植物，可在短时间内将砷迅速从土壤中转移并积累到地上部分，富集的砷可达地上部生物量干重的2.3%，远高于一般植物。蜈蚣草水通道家族

丁香园- 基础科研-实验动物与生化组胚- 2019-02-15 02:35:20

单基因GSEA富集到无关通路

用单基因gsea去对筛选到的lncRNA进行功能注释，研究的疾病是心脏病，用的是KEGG和GO基因集，但是用FDR小于0.25，pvalue小于0.05富集到了很多癌症通路，这些通路在后期可以删去

丁香园- 基础科研-细胞生物与生物信息- 2020-04-23 03:23:58

【求助】粪链球菌的培养与富集

我想询问一下冻干的粪链球菌如何复活,富集培养时选用什么样的培养基,因为我要往青贮里面添加,所以想让它大量繁殖,同时培养基最好还能价格低廉、容易得到。恳请各位大师赐教！

丁香园- 基础科研-微生物与免疫- 2005-06-12 02:59:08

怎么知道一批基因富集在哪些染色体

有了gene symbol 怎么知道一批基因富集在哪些染色体？不想要一个一个的去查

丁香园- 论文写作-统计与作图- 2018-09-09 09:41:03

肿瘤干细胞富集培养

最近刚接触胶质瘤干细胞方面的课题，求问大家用细胞系富集肿瘤干细胞的方法是否在发文时会有问题，最近浏览了相关文献发现大部分肿瘤干细胞相关文献都是从临床样本中培养获得肿瘤干细胞，所以先用干细胞培养基悬浮

丁香园- 基础科研-细胞技术与形态遗传- 2016-08-15 08:48:14

关于DAVID富集基因数量的问题，谢谢

请问前辈，用DAVID做富集的话，45个基因可以吗？25个基因呢，请问结果还可信性吗？谢谢。

丁香园- 基础科研-细胞生物与生物信息- 2015-06-26 01:52:02

请教]被肿瘤细胞相对富集的药物？

1。哪位知道什么药物（无毒最好）能够被肿瘤细胞相对富集？小分子或生物大分子都行。2。知道有谁尝试过Two-hit（两步法）的抗肿瘤思路吗？即通过一个本身无毒的药物相对富集标记肿瘤细胞，然后通过引入

丁香园- 肿瘤医学- 2006-02-24 16:44:06

关于GSEA富集分析，有一些问题请教老师。

请问老师为啥我的GSEA富集图片跟文章里面有些不太一样，别人都是红色区域和蓝色区域均分的，为啥我的跑的图片都集中到蓝色区域了。还有想问问老师我的结果高表达METTL14到底与WNT是正相关还是负相关

丁香园- 基础科研-细胞生物与生物信息- 2018-09-04 11:15:48

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