实验小白，最近想做某蛋白的乙酰化水平，我先用免疫沉淀富集，再用泛乙酰化抗体去拉，目前我认为需要变性前上清跑内参，变性后跑乙酰化水平，但是我想问一下，这样做免疫沉淀还需要做input组和IgG组
本人才学这方面的知识，看到有资料说，David数据库更新比较迟，请问前辈们，如果用r语言的enrichgo和enrichkegg来做，r语言富集分析的数据库是来源于什么数据库，结果是最新的吗？
求助各路大佬，下面A图和B图哪个表示【TG组抑制T signaling pathway】呀，（白线是我打的码），实在不会看ES为负值的GSEA，并求大佬稍稍讲解一下，琢磨整整一天了 T-T。以及对应的
run后报错---- Full Error Message ----After pruning,这是什么原因啊，前面设置有问题还是就是没有富集到基因？我的数据分了两组，每组3个样本，3万多个基因
一个大的基因集合作为背景，一个小的基因集合，先做富集分析！得到一个结果（可能是一个具体的结果，一个数值把），然后随机从背景基因集合中取跟小的基因集合大小相同的伪基因集合，随机1000次，算1000
（生信小白）各位老师好，我想问一下预测lncRNA的潜在通路，我先预测了它们的mRNA，用mRNA做了KEGG分析，得到了目标通路，那我要怎么反向推理目标通路的相关lnCRNA啊？以下是我做的KEGG